Calculating Protein Mass

Computational Mass Spectrometry

Descrizione

In un alfabeto pesato, ogni simbolo ha assegnato un peso; il peso di una stringa è la somma dei pesi dei suoi simboli. Il peso standard di ogni amminoacido è la sua massa monoisotopica. Il problema chiede la massa totale di una stringa proteica, sommando le masse monoisotopiche dei residui (usando la tabella delle masse monoisotopiche).

Given

Una stringa proteica P di lunghezza massima 1000 aa.

Return

Il peso totale di P (consultando la tabella delle masse monoisotopiche).

Sample Dataset

SKADYEK

Sample Output

821.392

La mia esecuzione

08/24/2026 11:24:47

Input · dataset.txt

QQMFVTFKVRSEGRKNRQMIECCGFGGLLEEAVFCMKNDNLIWAKGQTYNPEPTNYIEFIWQHVADETNHWHPLFHGSEEMVWVAGCHYVYSILDSPTISKWCHEWSLSLTKKKNPKHPQMPAHNFCRLWAVEMGDFMKKVDLFPNLTTMPDMTGRLYMLVRSVIKEEKRVESPFPDYHCYNTFPNRMLEIIVIKNDWCRCFPYVAMRVITPQVNRLAMMENRYSGDMPLWCSISWEYRHVPTMAQPHNEGTPTNPLRPTDYNCHCGKCWWKKSVCLSSWTCYMYNKFRLTDMVTVIKLGYDYIPTKQIQACWIGTAMCLKWYVHMAWKDATWGKIVAQHTDYIHLSQMVTTVRSGGPEVNVVGVQAVVCAATFIFWQCDLWNNYSGWASSPKKKISRRHVHNRMSQCIRHDFYPADGMRPWYSWYPNYDGELRTGWSLTCRSMITPWEIRELNQLKLGKKLEIGLAGKIGSEYIAEEVHMAPVVTGWPRMEEKANKTAGIKLDHMYQANCCCKVFVNWQHIPFFFLPMFIYTHMILKWKGFYECPNLFFMKEAEEKNGFFAFVQCLLWSVFEYPYHTIPNFHTAAMDPMAFGGKLCPIQFTEMHIGADDHHQRANDGRRLLHGQHVNPYWCLACKKMWYETRYHKIEGSWLMVRCWVVDPKWVWMYLHEHELLVCQQEKAAESMNACTWCGFYETVCAKIFCYCSGSGHLDVYKFMFHQIPVAGDCPKSEYKLLDAPKHYRQNCRFWHEQDGQQQASAQYASEHLFESQIQGELSTNVDHMDDNIDGLAGQGINGEPIGHAYEIQHCWHDPAHQCAFNSISISGK

Output · run_log.txt

96725.166

Esegui nel browser · Pyodide

Mostra il codice sorgente (problem.py)

mass_table = {
 "A":    71.03711,
 "C":   103.00919,
 "D":   115.02694,
 "E":   129.04259,
 "F":   147.06841,
 "G":   57.02146,
 "H":   137.05891,
 "I":   113.08406,
 "K":   128.09496,
 "L":   113.08406,
 "M":   131.04049,
 "N":   114.04293,
 "P":   97.05276,
 "Q":   128.05858,
 "R":   156.10111,
 "S":   87.03203,
 "T":   101.04768,
 "V":   99.06841,
 "W":   186.07931,
 "Y":   163.06333
}

arrotonda = lambda x: round(x * 1000) / 1000

def lettura(filename):
    with open(filename) as f:
         riga = f.readline()
         return riga.replace("\n", "")

def main():
    prot = lettura("dataset.txt")
    tot = 0
    for char in prot:
        tot += mass_table[char]
    print(arrotonda(tot))
             
if __name__ == "__main__":
    # execute only if run as a script
    main()

Soluzione JavaScript

Esegui ora, live

Mostra il codice sorgente

// Calculating Protein Mass (Rosalind ID: PRTM) - soluzione JavaScript
// indipendente, non una trascrizione di problem.py: stessa logica
// (somma delle masse monoisotopiche di ciascun amminoacido della
// proteina, arrotondata a 3 decimali), riscritta in modo idiomatico per
// JS.
//
// Nota sull'arrotondamento e sul formato numero: stesse considerazioni
// già fatte in prob.mjs (round-half-to-even di Python contro
// Math.round di JS, e ".0" finale per un risultato intero).
//
// Contratto: riceve il contenuto testuale di dataset.txt, restituisce
// l'output testuale (stessa forma dell'output Python).
const MASS_TABLE = {
  A: 71.03711, C: 103.00919, D: 115.02694, E: 129.04259, F: 147.06841,
  G: 57.02146, H: 137.05891, I: 113.08406, K: 128.09496, L: 113.08406,
  M: 131.04049, N: 114.04293, P: 97.05276, Q: 128.05858, R: 156.10111,
  S: 87.03203, T: 101.04768, V: 99.06841, W: 186.07931, Y: 163.06333,
};

function arrotonda(x) {
  return Math.round(x * 1000) / 1000;
}

function formatta(v) {
  return Number.isInteger(v) ? v.toFixed(1) : String(v);
}

export default function solve(datasetText) {
  const prot = datasetText.split("\n")[0].trim();

  if (!prot) {
    throw new Error("Input non valido: attesa una sequenza proteica non vuota");
  }

  let tot = 0;
  for (const char of prot) {
    const massa = MASS_TABLE[char];
    if (massa === undefined) {
      throw new Error(`Input non valido: carattere "${char}" non è un amminoacido riconosciuto`);
    }
    tot += massa;
  }

  return `${formatta(arrotonda(tot))}\n`;
}